A המחקר האחרון מזהה מה היא נגיף הקורונה החדש שאחראי למגיפת דלקת הריאות במחוז הוביי בסין- נגיף העטלף קשור לקורונווירוסים פתוגניים ידועים אחרים
השמיים 2019 נגיף כתר חדש (CoV) גורם לדלקת ריאות קטלנית שגבתה למעלה מ- 1300 נפשות, עם יותר מ- 52000 מקרים מאושרים של זיהום על ידי 13 בפברואר 2020, הכל בטווח של קצת יותר מחודש. אבל, מהו הנגיף הזה? האם זה נגיף חדש לגמרי? מאיפה זה בא? מדענים ממכוני מחקר מובילים בסין חברו לענות על שאלות אלו, ומחקר חלוצי זה פורסם ב כתב העת הרפואי הסיני.
https://www.youtube.com/watch?v=jFKWluuMdgs
בתחילת דצמבר כמה אנשים בעיר ווהאן שבפרובינציית הוביי בסין החלו לחלות לאחר שיצאו לשוק פירות ים מקומי. הם חוו תסמינים כמו שיעול, חום וקוצר נשימה, ואפילו סיבוכים הקשורים לתסמונת מצוקה נשימתית חריפה (ARDS). האבחנה המיידית הייתה דלקת ריאות, אך הסיבה המדויקת לא הוסברה. מה גרם להתפרצות החדשה הזו? האם מדובר בתסמונת הנשימה החריפה החריפה (SARS) -CoV? האם מדובר בתסמונת הנשימה במזרח התיכון (MERS) -CoV? כפי שמתברר, מדענים ביצעו מחקר לזיהוי הנגיף הזה בדצמבר לאחר ניתוח המקרים הראשונים. מחקר זה פורסם כעת ב כתב העת הרפואי הסיני וזהות הנגיף נקבעה - זהו וירוס חדש לחלוטין, הקשור קשר הדוק ל- CoV דמוי העטלף. ד"ר ג'יאנוויי וואנג (האקדמיה הסינית למדעי הרפואה, המכון לביולוגיה של פתוגן), חוקר מוביל במחקר, קובע כי "העיתון שלנו קבע את זהות ה- CoV ממקור העטלף שלא היה ידוע עד כה."
במחקר זה, מדענים ממכוני מחקר ידועים בסין, כמו האקדמיה הסינית למדעי הרפואה, המכון לביולוגיה של פתוגן, בית החולים לידידות סין-יפן ומכללת הרפואה פקין יוניון, גילו וזיהו במשותף את ה- CoV החדש - האשם העיקרי של התפרצות ווהאן - לפי רצף הדור הבא (NGS). הם התמקדו בחמישה חולים שאושפזו בבית החולים ג'ין יין-טאן בווהאן, רובם עובדים בשוק מאכלי הים הוואנאן בווהאן. חולים אלו סבלו מחום גבוה, שיעול ותסמינים אחרים, ואובחנו בתחילה שהם סובלים מדלקת ריאות, אך הם בעלי סיבה לא ידועה. מצבים מסוימים של חולים החמירו במהירות ל- ARDS; אחד אפילו מת. ד"ר וואנג אומר, "צילומי החזה של המטופלים הראו אטימות והתמזגות מעורפלים, האופייניים לדלקת ריאות. עם זאת, רצינו לברר מה גרם לדלקת ריאות, והניסויים הבאים שלנו חשפו את הסיבה המדויקת- CoV חדש שלא היה ידוע קודם לכן."
לצורך המחקר השתמשו המדענים בדגימות נוזלים של שטיפת הסימפונות הסימפונות (BAL) שנלקחו מהחולים (BAL הוא הליך בו נוזל סטרילי מועבר לריאות באמצעות ברונכוסקופ ואז נאסף לניתוח).
ראשית, המדענים ניסו לזהות את הנגיף על ידי רצף הגנום, באמצעות טכנולוגיית NGS. NGS היא שיטת הסינון המועדפת לזיהוי פתוגנים לא ידועים מכיוון שהיא מגלה ושוללת במהירות את כל המיקרואורגניזמים הפתוגניים הידועים במדגם. בהתבסס על רצף של ה- DNA / RNA מדגימות הנוזל BAL, המדענים גילו שרוב הקריאות הוויראליות שייכות למשפחת ה- CoV. לאחר מכן הרכיבו המדענים את ה"קריאות "השונות השייכות ל- CoVs ובנו רצף גנומי שלם לנגיף החדש; רצפים אלה היו דומים בין 99.8-99.9% בקרב כל דגימות החולים, ואישרו כי נגיף זה היה הפתוגן הנפוץ בכל החולים. יתר על כן, באמצעות ניתוח הומולוגיה, שבו משווים רצף גנום מול רצפי גנום ידועים אחרים (עם סף מוגדר מראש של 90% כדי שייחשב לרצף "חדש"), הם אישרו שרצף הגנום של נגיף חדש זה הוא 79.0%. דומה ל- SARS-CoV, כ -51.8% דומה ל- MERS-CoV, וכ- 87.6–87.7% בדומה ל- COVs אחרים דמויי SARS מעטלפי פרסה סיניים (המכונים ZC45 ו- ZXC21). ניתוח פילוגנטי הראה כי הרצפים של חמשת זני ה- CoV שהושגו היו הקרובים ביותר לזנים שמקורם בת, אך יצרו ענפים אבולוציוניים נפרדים. ממצאים אלה מראים בבירור כי הנגיף מקורו בעטלפים. ד"ר וואנג קובע, "מכיוון שקווי הדמיון של הגן המשוכפל הנגיפי עם כל הנגיפים ה"דומים "הידועים האחרים הם עדיין פחות מ 90%, ובהתחשב גם בתוצאות הניתוח הפילוגנטי, אנו רואים כי אכן מדובר ב- CoV חדש, שלא היה ידוע בעבר. הנגיף החדש הזה נקרא באופן זמני 2019-ncov."
לבסוף, המדענים עברו "לבודד" את הנגיף מדגימות הנוזל BAL על ידי בדיקה האם דגימות הנוזל הראו השפעה ציטופתית לקווי התאים במעבדה. התאים שנחשפו לדגימות הנוזל נצפו במיקרוסקופ אלקטרונים, והמדענים מצאו מבנים אופייניים דמויי CoV. הם השתמשו גם בחיסון פלואורסצנטי - טכניקה המשתמשת בנוגדנים ספציפיים שתויגו עם צבעי פלואורסצנט. לשם כך הם השתמשו בסרום מהחולים המחלימים (שהכילו נוגדנים), שהגיבו עם החלקיקים הנגיפיים שבתוך התאים; זה אישר שנגיף זה אכן היה הגורם לזיהום.
מחקר זה סולל את הדרך למחקרים עתידיים להבין טוב יותר את הנגיף ואת מקורותיו, במיוחד לאור התפשטותו המהירה, יכולתו לגרום ל- ARDS קטלני והבהלה שנגרמה בעקבות ההתפרצות. למרות ש -4 מתוך 5 המטופלים מהם זוהה נגיף זה היו משוק פירות ים בווהאן, מקורו המדויק של ההדבקה אינו ידוע. ה- COV יכול היה להיות מועבר לבני אדם באמצעות נשא "ביניים", כמו במקרה של SARS-CoV (בשר סיווטת דקל) או MERS-CoV (גמל). ד"ר וואנג מסכם, "כל ה- CoVs האנושיים הם זואונוטיים, ומספר ה- CoVs האנושי מקורם בעטלפים, כולל SARS- ו- MERS-CoVs. המחקר שלנו מראה בבירור את הצורך הדחוף במעקב קבוע אחר העברת CoVs ממקור עטלף לבני אדם. הופעתו של נגיף זה מהווה איום עצום על בריאות הציבור, ולכן יש חשיבות קריטית להבין את מקור נגיף זה ולהחליט על הצעדים הבאים לפני שנחזה בהתפרצות בקנה מידה גדול יותר.".
