נושא הדרכונים החדשים לאזרחי המדינה קהילת מזרח אפריקה הושעה באופן זמני כדי לאפשר שילוב של מאפיינים חדישים חדשים במהדורה הבאה. נכון לעכשיו, הדרכונים אינם ניתנים לקריאה במכונה ואינם נושאים נתונים ביומטריים בשבבי מחשב שהוכנסו, וכדי להפוך אותם למקובלים יותר, יש לסדר תחילה את התוספות החדשות הללו.
הדרכונים היו פופולריים באוגנדה ובקניה, שם נדרשו המטיילים להחתים את הדרכונים שלהם פעם בחצי שנה אם הם עוברים את הגבולות הלאומיים לאחת המדינות החברות ב- EAC, אך עלו גם טענות לפקידי הגירה בגבולות היבשה ובשדות התעופה. פשוט התעלם מכללים אלה והמשיך להחתים אותם בכל מקרה כמו דרכונים לאומיים. בורונדי ורואנדה, לאחר שהצטרפו ל- EAC בשנה שעברה, טרם יישמו את נושא מסמכי הנסיעות הללו.
דרכוני ה- EAC גם לא היו מקובלים בדרך כלל מעבר לאזור, כאשר מטיילים קבועים רבים נושאים דרכונים לאומיים וגם EAC, מצב שהמזכירות של הקהילה המזרח-אפריקאית בארושה גם הבטיחה להתייחס בזמן לתחילת הנפקת דרכוני ה- EAC מהדור הבא. . בינתיים אזרחי חמש המדינות החברות ישתמשו בדרכונים לאומיים משלהם לטיולים ברחבי האזור.
