Caris Life Sciences® אמורה להציג ממצאים המספקים הבנה עמוקה יותר שביטוי גידול של גנים הקשורים להיקף החשיפה לתרופות, בשכבות לפי סטטוס p53, קשור לתוצאות קליניות במשטרים הכימותרפיים השכיחים המשמשים לטיפול בסרטן המעי הגס גרורתי (CRC). תוצאות אלו יוצגו במפגש השנתי של האגודה האמריקאית לחקר הסרטן (AACR) לשנת 2022 שתתקיים ב-8 עד 13 באפריל, 2022 בניו אורלינס, לואיזיאנה.
המחקר עם הפוסטר שכותרתו, "חתימות גנים פרוגנוסטיות וחזויות הנגרמות על ידי תרופות לחולי סרטן המעי הגס בהתאמה אישית על סמך מצב p53 וטיפול ב-FOLFOX, 5-FU, oxaliplatin או irinotecan" (תקציר מס' 1231), הובל על ידי וואפיק אל-דיירי. , MD, Ph.D., FACP, מנהל המרכז לסרטן לגורטה באוניברסיטת בראון, דיקן עמית בבית הספר לרפואה וורן אלפרט, חבר ב-Caris's Precision Oncology Alliance (POA). POA של קאריס היא רשת הולכת וגדלה של מרכזי סרטן מובילים ברחבי העולם המשתפים פעולה לקידום אונקולוגיה מדויקת ומחקר מונחה סמנים ביולוגיים. עבודה זו מוצגת בניו אורלינס על ידי לינדזי קרלסן, סטודנטית לתואר שני בפתוביולוגיה במעבדת EL-DEIRY בבראון.
מטרת מחקר זה הייתה לזהות סמנים ביולוגיים מנבאים לכימותרפיות המשמשות ב-CRC. המחקר השתמש בשורות תאים CRC כדי לזהות גנים מבוטאים בצורה דיפרנציאלית בעקבות טיפול ב-5-fluorouracil, irinotecan או oxaliplatin ושכבה את החתימות על סמך מצב p53. ממחקרים חוץ-גופיים אלה, החוקרים בדקו אם הגנים וחתימות הגנים הללו יכולים לחזות תוצאות של חולי CRC בעקבות כימותרפיה (FOLFOX, 5-fluorouracil, irinotecan או oxaliplatin). 2,983 דגימות מטופלים מסוג פרא ו-6,229 דגימות של P53 CRC עם אובדן תפקוד נותחו על ידי רצף DNA/RNA של הדור הבא ב-Caris Life Sciences. תוצאות ההישרדות בעולם האמיתי הושקו מנתוני תביעות ביטוח והערכות קפלן-מאייר. לביטוי גנים פרוגנוסטי ולא פרוגנוסטי הייתה השפעה משמעותית על תוצאות ההישרדות בעקבות טיפולים תרופתיים ספציפיים.
"מחקר זה עוזר לנו להבין את החשיבות שיש לחתימות גנים בהפגנת יכולת ניבוי משופרת בהשוואה לתמלולים בודדים", אמר אל-דיירי. "בגישור מחקר בסיסי וקליני, מחקר זה מאפשר לנו להבין טוב יותר אילו טיפולים נוטים יותר להועיל לחולי CRC." המחקר מצא שביטוי גידול של גנים הקשורים לחשיפה לתרופות יכול לחזות תוצאות לאחר טיפול כימותרפי:
• EGR1 ו-FOS mRNA גבוהים מנבאים באופן עצמאי תגובה ל-FOLFOX בחולים עם גידולי p53 מסוג פרא.
• mRNA נמוך של CCNB1 מתאם עם פרוגנוזה טובה של חולי CRC עם גידולים המכילים מוטציות אובדן תפקוד מסוג TP53.
• ביטוי נמוך של BTG2 מנבא פרוגנוזה טובה יותר בחולים עם גידולים שעברו מוטציה MSI-High TP53.
• חתימות גנים עשויות להפגין יכולת ניבוי משופרת בהשוואה להשפעות תמליל בודדות.
"קאריס מתמקדת בסמנים ביולוגיים שיכולים לחזות את תגובת המטופל לטיפולים החדשים ביותר, אך גם בכימותרפיות בדוקות ונכונות כמו FOLFOX," אמר W. Michael Korn, MD, קצין רפואי ראשי ב-Caris. "אנו נרגשים לראות את יכולת המחקר התרגום המועצמת על ידי הנתונים הרב-אומיים והכלים האנליטיים האדירים שקאריס פיתחה וממשיכה להתקדם בהם."
הפרופיל המולקולרי המקיף של קאריס מעריך את הביטוי של אקסום שלם (DNA), ביטוי שלם של תעתיק (RNA) וחלבון, ומספק משאב ללא תחרות ואת הדרך האידיאלית קדימה לערוך את המחקר התרגום כדי להאיץ את הגילוי לגילוי, אבחון, ניטור, בחירת טיפול ופיתוח תרופות לשפר את מצב האדם.
קאריס תציג נתונים נוספים ממחקרים המדגימים את התפקיד הקריטי של רפואה מדויקת ופרופיל מולקולרי בטיפול בסרטן. כל המצגות יהיו זמינות באינטרנט דרך האתר של קאריס החל מה-8 באפריל, 2022.
מצגות נוספות חושפות את ההשפעה של פרופיל מולקולרי מקיף ויכולת פעולה קלינית
• אפיון מקיף של שינויים ב-FGF/FGFR בסרטן שד פולשני (תקציר מס' 5793) איתות FGFR הוא מרכזי לשגשוג תאי סרטן, הגירה, אנגיוגנזה והישרדות; שינויים ב-FGFR הפכו ניתנים לפעולה קלינית במספר הולך וגדל של סוגי סרטן. מחקר זה העריך את השכיחות והאפיון של שינויים רבים ב-FGF/FGFR בלמעלה מ-12,000 סוגי סרטן שד פולשניים והדגיש את ההטרוגניות העצומה של שינויים ב-FGF/FGFR בתתי סוגים היסטולוגיים ומולקולריים שונים, כמו גם באתרים גרורתיים שונים של סרטן השד. יתרה מכך, הקשרים של שינויים ב-FGFR ועמידות לטיפולים הוצגו במסד נתונים קליני גדול עם תוצאות מולקולריות תואמות.
• מאפיינים גנומיים וחיסונים של תת-סוגים של EGFR בסרטן ריאות של תאים לא קטנים (NSCLC) (תקציר מס' 4119) בעוד שגידולי NSCLC מוטנטיים EGFR בדרך כלל עמידים למעכבי PD-1/PD-L1, תת-קבוצה קטנה של חולים יכולה לקבל תגובות עמידות . גידולים עם מוטציה EGFR מפגינים הטרוגניות מולקולרית משמעותית, עם זאת, יש חוסר בהירות לגבי הפרופילים הגנומיים והחיסוניים של תת-סוגי מוטציות EGFR, והבהרה נוספת של זה עשויה לסייע בזיהוי חולים שסביר שיגיבו לטיפולים מבוססי חיסון. מינוף הנתונים המולקולריים הרב-אומיים שנוצרו על ידי רצף הדור הבא של DNA ו-RNA על קבוצה גדולה של גידולי NSCLC, מחקר זה מאשר את הירידה באימונוגניות הקשורה לרוב תת-הסוגים של מוטציות EGFR המתבטאות בסמנים ביולוגיים כולל PD-L1, TMB ו-CD8+ T חדירת תאים; וחושף מוטציות EGFR נדירות הקשורות לפרופיל חיסוני חיובי שעשויות להצביע על היענות לטיפול חיסוני.
מה לקחת מהמאמר הזה:
- This study evaluated the incidence and characterization of numerous FGF/FGFR alterations in over 12,000 invasive breast cancers and highlighted the tremendous heterogeneity of FGF/FGFR alterations in various histologic and molecular subtypes as well as different metastatic sites of breast cancer.
- Caris Life Sciences® is to present findings that provide a deeper understanding that tumor expression of genes related to extent of drug exposure, stratified by p53 status, is associated with clinical outcomes on the common chemotherapeutic regimens used to treat metastatic colorectal cancer (CRC).
- This work is being presented in New Orleans by Lindsey Carlsen, a Pathobiology graduate student in the EL-DEIRY Lab at Brown.
